质疑供应商提交的质疑函格式不合规，采购代理机构如何处理？

答：只要供应商在法定质疑期内发出的质疑函，无论内容如何，采购代理机构不得拒收，如果其质疑函内容格式或内容不合规，应当要求其进行修正完善，确认无误后依规进行答复。

法律依据为《政府采购质疑和投诉办法》（财政部令第94号）第十三条采购人、采购代理机构不得拒收质疑供应商在法定质疑期内发出的质疑函，应当在收到质疑函后7个工作日内作出答复，并以书面形式通知质疑供应商和其他有关供应商。

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